登山口の奥二股からは頂上への約６キロの登山コースがあります。
谷間に広がる広い河原はキャンプサイトとして人気。また、十字架が印象的な蝦夷キリシタン殉教の地もあります。中千軒岳の高山植物が咲き乱れる自然の花畑、遠くまで見渡せる稜線を越え、千軒清水の「聖水」を汲めば頂上はもうすぐ。
頂上からは、ふもとにひろがる町並みや津軽海峡を見渡すことができ、その開放感はまた格別です。

大千軒岳登山コース途中にある「えぞキリシタン殉教の碑」は奥二股登山口から登って約２時間、3.5キロの地点にあります。

キリシタンが徳川幕府の迫害をさけて東北、蝦夷地へと移動しはじめたのは、1612年頃のことです。彼等にとって、蝦夷＝北海道は逃亡の末の終着地でした。
幕府はキリシタン禁教令を発し、その２年後の1614年には更に大がかりな追放が始まりました。教会は焼かれ、外国人宣教師や日本人の信徒達はマニラ(フィリピン)やマカオへと強制送還されました。その後も幕府のキリシタン弾圧は続き、信徒は当時まだ比較的規制の緩かった東北へと移動をはじめました。しかし東北地方の秋田、津軽でも徐々に弾圧は厳しくなり、キリシタン達は更に北の地へと渡らざるをえなくなりました。
蝦夷へと渡ったほとんどの信徒は鉱山へと入り込み、砂金堀りの労働者となっていきました。彼等はキリストへの強い信仰によって結ばれており、その結束力は大変強く、生死も共にする事を厭わない程でした。
1637年に島原の乱が起こり、1639年には、松前藩は遂に幕命によりキリシタンを処刑することになり、千軒岳周辺で106名の信者が松前藩の数名の役人と300名の兵士によって処刑されたのでした。
昭和34年(1959)、函館カトリック教徒たちによって金山番所に十字架が建てられ、巡礼ミサが行われるようになりました。現在もこの巡礼は続けられ、毎年７月下旬の日曜日には夏の千軒岳にミサの聖歌が静かに響き渡ります。十字架は千軒平にもあり、ミサの日には信徒が登山して山頂での礼拝も行われています。
昭和36年(1961)には、追悼の意を込めて、大きな木の十字架が藩所跡に立てられました。えぞキリシタン106名の殉教は、こうしてこれからも人々の心に語り継がれていく事でしょう。